Día Mundial de la lucha contra el SIDA.
Publicado por: Diagnostics News | Viernes, 01 Diciembre 2017 | 12:56
(Rosario).- Cibic aumenta la sensibilidad en sus estudios de resistencia por implementación de secuenciación de última generación (NGS).
En el camino hacia la erradicación de la epidemia por VIH, Cibic implementa el primer test de resistencia basado en NGS del país y uno de los primeros de Latinoamérica.
El nuevo test basado en NGS reemplaza a su predecesor, basado en secuenciación Sanger, incrementando la calidad y cantidad de información reportada, sin aumentar costos ni tiempos de proceso. Incorpora las ventajas del uso de NGS, una menor tasa de error, uso de análisis bioinformático automatizado y aumento de sensibilidad. Este aumento de sensibilidad permite detectar mutaciones en variantes minoritarias, indetectables por metodologías convencionales. Dado que la tasa de falla se incrementa en pacientes con mutaciones en variantes minoritarias, la detección de las mismas incrementaría la eficacia de los esquemas antirretrovirales.
El “valor agregado” presente en el nuevo reporte
El nuevo reporte es generado a partir del software Paseq, basado en el algoritmo de la universidad de Stanford. El mismo presenta el análisis de resistencia para cuatro umbrales de detección, producto de la aplicación de diferentes filtros de sensibilidad (20%, 10%, 5%, 1%). El resultado obtenido con el filtro del 20% se corresponde con el resultado de las técnicas convencionales. Por debajo de este límite se comienzan a detectar las variantes minoritarias que pueden modificar la decisión clínica. El médico tomará el umbral de detección adecuado para guiar la elección de la terapia, la cual dependerá del contexto clínico y los antecedentes del paciente a tratar.
Ejemplo de reporte de test de resistencia por NGS. Cada columna presenta la acumulación de mutaciones con diferentes filtros de sensibilidad. En color se evidencia el nivel de resistencia para cada droga antirretroviral.
Fuente: Diagnostics News – https://www.diagnosticsnews.com